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內(nèi)參蛋白,你選對(duì)了嗎?

2020/3/18 14:41:27??????點(diǎn)擊:

內(nèi)參蛋白是用來(lái)確保蛋白上樣量一致性,量化目的蛋白的表達(dá)情況,是免疫印跡(WB)和免疫熒光(IF)等實(shí)驗(yàn)結(jié)果定量分析或定性比較的重要標(biāo)尺。

 

內(nèi)參蛋白,你選對(duì)了嗎?

 

內(nèi)參蛋白主要是一些持家基因,這些持家基因執(zhí)行大量的基本功能,并持續(xù)在多種組織和細(xì)胞中高水平表達(dá)。 常見(jiàn)內(nèi)參蛋白包括Actin、Tubulin、GAPDH、Histone H3等。但是,研究不同類型的蛋白,對(duì)內(nèi)參的選擇是有講究的,如1)胞漿蛋白的內(nèi)參與胞核蛋白的內(nèi)參是不一樣的;2)在一定的實(shí)驗(yàn)條件下,內(nèi)參蛋白的表達(dá)發(fā)生明顯的變化時(shí)需要選擇其他表達(dá)不變或者變化很小的蛋白;3)當(dāng)研究的蛋白的分子量與內(nèi)參接近時(shí),需要選擇分子量與目的蛋白的分子量差距比較大的蛋白等。

 

以下這張圖歸納了不同細(xì)胞組分對(duì)應(yīng)的內(nèi)參及其分子量,掌握了這張圖,內(nèi)參選擇不再難。快動(dòng)動(dòng)你的手指收藏起來(lái)吧!

該圖來(lái)自CST Guide 科研寶典:《CST Guide: Pathways & Protocols》。

 

多數(shù)情況下,內(nèi)參蛋白的表達(dá)量很高且穩(wěn)定,但是,特定的實(shí)驗(yàn)條件(環(huán)境壓力,外界因素刺激等)會(huì)引起這些內(nèi)參蛋白的變化,因此有些內(nèi)參在不同實(shí)驗(yàn)條件或研究模型下不適合選擇,我們總結(jié)了最近研究的結(jié)果,列出有些實(shí)驗(yàn)條件下不適的內(nèi)參供參考:

 

研究結(jié)腸癌的發(fā)生及轉(zhuǎn)移時(shí),細(xì)胞骨架蛋白Vinculin不適合做全細(xì)胞的內(nèi)參。近期研究表明,結(jié)腸癌中Vinculin表達(dá)的減少和增加與致癌和轉(zhuǎn)移有關(guān)聯(lián)(1)。

 

在環(huán)境壓力下,HSP70和HSP90被誘導(dǎo)而表達(dá)發(fā)生變化,盡管HSP70和HSP90正常情況下是組成性表達(dá)的分子伴侶,能夠保持蛋白合成穩(wěn)態(tài),但環(huán)境壓力下,HSP70和HSP90不適合胞漿蛋白的內(nèi)參(2)。

 

當(dāng)細(xì)胞發(fā)生凋亡的時(shí)候,核多聚(ADP-核糖) 聚合酶PARP和核膜的結(jié)構(gòu)組分Lamins,都不適合做核蛋白的內(nèi)參。在凋亡細(xì)胞體內(nèi),PARP是caspase-3裂解的主要靶蛋白之一(3)。Lamin A/C能夠被caspase-6切割,可以作為caspase-6激活的標(biāo)志。在凋亡過(guò)程中,Lamin A/C能夠被特異地剪切成大片段(41-50 kDa)和小片段 (28 kDa)。Lamin的剪切會(huì)引起細(xì)胞核的失調(diào)和細(xì)胞死亡(4,5)。

 

VDAC(電壓依賴性陰離子通道) 廣泛表達(dá),定位于線粒體外膜,通常認(rèn)為這是代謝傳入或傳出線粒體的主要方式。另外,這個(gè)通道在凋亡信號(hào)中發(fā)揮重要作用。Bcl-2家族蛋白調(diào)控凋亡過(guò)程中線粒體通透性的改變,他們能結(jié)合VDAC改變通道的動(dòng)力(6)。VDAC的同二聚體化可能是一種改變線粒體通透性和促進(jìn)細(xì)胞色素C 釋放的機(jī)制。

 

Cofilin 屬于一組保守的小Actin-結(jié)合蛋白家族,在胞質(zhì)分裂,內(nèi)吞,胚胎發(fā)育,壓力應(yīng)激和組織再生過(guò)程中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。在刺激因素作用下,Cofilin作為提前存在的細(xì)絲促進(jìn)Actin肌動(dòng)蛋白絲的再生(7)。Cofilin的第3位絲氨酸被LIMK或TESK磷酸化后會(huì)抑制Cofilin的這種作用(8)。

 

Actin,一種廣泛表達(dá)的真核蛋白,是細(xì)胞骨架的重要組分。研究證明在原始乳腺癌細(xì)胞中Actin是高度磷酸化的(9)。研究也發(fā)現(xiàn)凋亡條件下體外和心臟肌肉以及骨骼肌中都能觀察到Actin的清除(10),因此,不適用于骨骼肌的樣品。Caspase-3對(duì)Actin的清除會(huì)加速泛素/蛋白酶體依賴的肌肉蛋白酶解(11)。 細(xì)胞生長(zhǎng)條件的改變以及與胞外基質(zhì)組分的相互作用都可能會(huì)導(dǎo)致Actin蛋白合成的變化 。

 

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶), 在糖酵解過(guò)程中將3-磷酸甘油醛進(jìn)一步磷酸化。雖然在不同組織中的表達(dá)水平有差異,但GAPDH普遍被認(rèn)為是一個(gè)組成型表達(dá)的持家蛋白。正是由于這個(gè)原因,GAPDH的mRNA和蛋白通常在對(duì)其它有變化的靶蛋白測(cè)定實(shí)驗(yàn)時(shí)作為對(duì)照。當(dāng)代謝信號(hào)通路受到影響時(shí)GAPDH 不適合做內(nèi)參等。

 

球形微管蛋白亞基包含微管建筑塊,由α/β-tubulin異源二聚體形成所有真核細(xì)胞的tubulin亞單位。 對(duì)抗微生物和抗有絲分裂藥物耐受性的不同而會(huì)導(dǎo)致Tubulin的表達(dá)發(fā)生變化 。

 

為了滿足你各種實(shí)驗(yàn)的需要,CST 為您準(zhǔn)備了含優(yōu)選貨號(hào)的內(nèi)參Sampler kit,性價(jià)比高,購(gòu)買(mǎi)方便。

 

#4670 Loading Control Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate) 

 

#5142 Loading Control Antibody Sampler Kit 

 

#9774 Loading Control Antibody Sampler Kit (Mouse) 

 

內(nèi)參相關(guān)產(chǎn)品,請(qǐng)看下表:

 

Loadong Control

 No.

Applications

Reactivity

Vinculin

13901

W IHC-P F

H M R Mk

18799

W

H M R Mk

4650

W

H M R Mk Dg

HSP90

4877

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk (B)

70657

F

H M R Mk (B)

79641

W

H M R Mk (B)

4874

W IHC-P

H M R Mk Dm Z (C) (B)

4875

W IHC-P F

H M R Mk (B)

HSP70

46477

W IHC-P

H

4873

W IP IHC-P IF-IC F

H Mk

4872

W IHC-P

H M R Mk B

4876

W

H M R Mk

HSP60

12165

W IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

46611

W

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

56831

F

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

4869

W IF-IC F

H M R Mk Dm

4870

W IF-IC F

H M R Mk Dm

MEK1/2

13033

W

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

28708

F

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

4694

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk

8727

W IF-IC F

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

9122

W IP

H M R Mk Dm (C) (X)

9126

W

H M R Mk (Dg)

GAPDH

2118

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk B Pg (Pg)

3683

W

H M R Mk B Pg (Pg)

3906

IF-IC F CS-CA

H M R Mk B Pg (Pg)

3907

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Pg)

5014

W

H M R Mk B Pg (Pg)

5174

W IHC-P IF-IC

H M R Mk (Pg)

8884

W

H M R Mk (Pg)

97166

W

H M R Mk

PARP

6704

IP

H M R Mk

9532

W IP IF-IC

H M R Mk

9542

W

H M R Mk

Lamin  A/C

4777

W IP IHC-P IF-F IF-IC F

H M R Mk

53496

F

H M R Mk

8617

IF-F IF-IC F

H M R Mk

2032

W IHC-P

H M R (B)

Lamin  B1 

12586

W

H M R (Mk) (Pg)

13435

W IP

H M R (B) (Dg) (Pg)

15068

W

H M R (B) (Dg) (Pg)

HDAC1

34589

W IP IF-IC ChIP

H M R Mk

5356

W IP

H M R Mk

59581

W

H M R Mk

2062

W

H M R Mk

TBP

12578

W IP ChIP

H Mk

44059

W IP ChIP

H M R Mk (C) (B)

8515

W

H M R Mk

PCNA

13110

W IP IHC-P IF-F IF-IC F

H M R Mk

2586

W IP IHC-P IF-IC F

H M R Mk B Pg

8580

IF-IC F

H M R Mk B Pg

HistoneH3

12167

F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

12230

IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

5748

W

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

4620

ChIP

H M (R) (Hm) (Mk) (C) (Dm) (X)  (Z) (B)

5192

W

H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg

12648

W

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

14269

W IHC-P IF-IC F ChIP

H M R Mk

3638

W

H M R Mk (Dm) (X) (Hr)

3680

IHC-P

H (M) (R) (Mk) (Dm) (X) (Hr)

4499

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

82241

F CS-CA

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

9717

W

H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg

2650

ChIP

H M (R) (Mk) (C) (Dm) (X) (Z)  (B) (Hr)

9715

W

H M R Mk Z B Pg (Dm)

VDAC 

12454

W

H M R Mk

4661

W

H M R Mk

4866

W IHC-P

H M R B

COX IV

11967

W IP IHC-P IF-IC

H M R Mk

4850

W IP IHC-P IHC-F IF-IC F

H R Mk Z B Pg

4853

IF-IC F

H R Mk Z B Pg

5247

W

H R Mk Z B Pg

7561

IF-IC F

H R Mk Z B Pg

8692

IF-IC

H R Mk Z B Pg

8693

IF-IC

H R Mk Z B Pg

4844

W IP IHC-P F

H M R Mk B

α-Actinin 

12413

W

H M R Mk (Z)

6487

W IF-IC

H M R Mk (Z)

3134

W IF-IC

H M R Hm Mk

β-Actin

12262

W

H M R Hm Mk Dg

12620

W

H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg)

3700

W IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk Dg

4970

W IHC-P IHC-F IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

5057

W F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

5125

W

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8046

IF-IC

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8457

W IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg)

8584

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8844

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

9470

IF-IC

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

4967

W

H M R Hm Mk Mi Dm Z B (C) (X)  (Dg) (Pg) (Hr)

α-Tubulin

12351

W

H M R Mk

2125

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

3873

W IHC-P IF-IC

H M R Mk

4285

W

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5046

IF-IC F

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5059

IF-IC

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5063

IF-IC F CS-CA

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

8058

IF-IC F

H M R Mk

9099

W

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

2144

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Dm B (X)

β-Tubulin

15115

W IHC-P IF-IC

H M R Mk

2128

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

3623

IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

3624

IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

5346

W

H M R Mk Z B (C)

56739

W

H M R Mk

2116

IF-IC

H M R Mk Z B (C)

6181

W

H M R Mk Z B (C)

7634

IF-IC

H M R Mk Z B (C)

86298

W IHC-P IF-IC

H M R Hm Mk

2146

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Z B (X)

Cofilin

5175

W IF-IC

H M R Mk Dg

8503

W

H M R Mk Dg

3318

W

H M R Mk B

Profilin-1

3246

W

H M R Hm Mk Dg

3237

W IF-IC F

H M R B

Cadherin

4073

W

H M R

4068

W IP IHC-P

H M R Mk Dm Z B

Na,K-ATPase

3010

W

H M R Hm Mk Z

CD71 

13113

W IP IF-IC F

H

13208

W IP IF-IC

H

82582

F

H

Caveolin-1

3267

W IP IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk B Dg

3238

W IP IHC-P IHC-F IF-IC F

H M R Hm Z B Pg

12506

W

H M R Hm Mk B Dg

Sampler  Kit

為了滿足你各種實(shí)驗(yàn)的需要,CST 為您準(zhǔn)備了含優(yōu)選貨號(hào)的內(nèi)參Sampler kit,性價(jià)比高,購(gòu)買(mǎi)方便。

9774

Loading Control  Antibody Sampler Kit (Mouse)

4670

Loading Control  Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate)

5142

Loading Control  Antibody Sampler Kit

 

參考文獻(xiàn):

1.         Yang, H.J. et al. (2010) Cancer Invest 28, 127-34.

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3.         Tewari, M. et al. (1995) Cell 81, 801-809.

4.         Oberhammer, F.A. et al. (1994) J Cell Biol 126, 827-37.

5.         Rao, L. et al. (1996) J Cell Biol 135, 1441-55.

6.         Shimizu, S. et al. (1999) Nature 399, 483-7.

7.         Condeelis, J. (2001) Trends Cell Biol 11, 288-93.

8.         Toshima, J. et al. (2001) J Biol Chem 276, 31449-58.

9.         Lim, Y.P. et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10, 3980-3987.

10.      Communal, C. et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99, 6252-6256.

11.      Du, J. et al. (2004) J. Clin. Invest. 113, 115-123.

 
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